晚上醒来的时候觉得口苦，可能是以下几种原因所致：1、环境因素：比较的干燥环境下，晚上睡觉的时候可能不自觉张口呼吸，会引起嘴巴里面有干、苦的感觉；2、口腔病变：口腔本身的问题，可能会导致醒来嘴巴发苦，比如有慢性牙龈、牙周炎症；3、消化系统病变：由于口腔与消化道密切相连，因此有消化系统的病变，常见的如慢性胃炎，尤其是伴有胆汁反流的慢性胃炎，部分患者常觉得口苦。特别是晚上醒来的时候，口苦的感觉可能会更加明显，因为胆汁是偏碱性发苦的感觉；4、呼吸系统病变：口腔与呼吸道也相通，有时候呼吸道的疾病，比如急性支气管炎、咽喉炎，都可能会导致口腔发苦；5、药物因素：某些药物也可能会导致嘴巴发苦，常见的比如克拉霉素；6、食物因素：某些食物也可能会导致嘴巴发苦。