支原体是微生物的一种，艾滋病是一种病毒性疾病，所以两个疾病完全不一样。支原体感染最常见的是小孩呼吸道感染、肺部支原体感染等。艾滋病为经过特殊途径感染的疾病，比如最常见的性途径传播，个别的就是通过母婴传播，即母亲患有艾滋病病，然后传给胎儿。另外艾滋病还可以通过乳汁传播和血液传播，比如艾滋病患者的血液输给正常人以后，正常人可能会感染艾滋病病毒。支原体是非典型肺炎的代表性病原菌之一，主要表现是间质性肺炎，临床表现以发热、咳嗽为主。此外，儿童感染肺炎支原体的几率比较高，目前社区获得性肺炎中的儿童肺炎，有40%-50%的患病原因可能由支原体感染引起的。支原体与艾滋病治疗时的药物也完全不一样，支原体一般都是使用大环内酯类药进行治疗，像红霉素、多西环素等可用于治疗支原体肺炎；而艾滋病病毒的治疗与支原体感染完全不一样，它是用抗病毒药物进行治疗。