肛周脓肿与肛瘘是同一疾病的两个不同阶段的称呼。无论是肛瘘还是肛周脓肿，都在肛门内2cm左右。有一个组织叫肛窦，与肛腺连接。肛腺是隐形的肉眼看不见的管道，生理作用是分泌黏液，从肛窦排泄出来，润滑粪头。肛腺分布在肛门直肠下段，让粪便更好排出，这是生理作用。但是当身体的免疫力差、大便过干或者拉肚子，就会损伤肛窦组织。这时候粪便和肠道中的细菌就从损伤肛窦，进入肛门外面，引起肛门组织的感染。感染不能及时制止，就会进一步形成肛周脓肿。