2岁宝宝阴茎红肿流脓的原因如下：1、包皮龟头炎：此时仔细查体挥发性，2岁宝宝可能有包皮过长、包茎的情况，加之最近喝水少、天气炎热、出汗多、活动量大、排尿少，在尿液减少冲刷的情况下，细菌在局部滋生，可能会诱发包皮龟头炎，这时候宝宝阴茎有红肿、疼痛，同时会有脓性分泌物；3、尿路感染：如果宝宝在阴茎红肿流脓的同时，有尿急合并尿痛，在排尿过程中有尿道灼烧感、异物感，有针扎样、刀刺样的感觉，可能是典型的尿路感染。出现这种情况，一定要让宝宝多喝水、多排尿，让尿液冲刷局部，同时可以用红霉素眼膏均匀涂抹在包皮，或阴茎头周围，起到杀菌、消炎、止痛的作用。如果宝宝经常出现这种情况，也可以考虑做包皮环切手术，虽然2岁年龄偏小，但如果宝宝经常阴茎头或者包皮口红肿流脓，也可以将多余的包皮切除掉。切除以后，细菌并没有感染的机会，可能有利于病情好转。