小肠克罗恩病最常见的症状就是腹泻、腹痛，腹痛一般在餐后比较明显，疼痛的位置常位于脐周以及右下腹，便后可以出现一些缓解。小肠穿孔在克罗恩病的发生比例相对来说是比较高的一种情况，病人会出现突发性的腹痛、腹肌紧张以及发烧的症状，需要及时去医院进行就诊，进行X线片检查。X线下可以看到腹腔有游离性气体，通常需要急诊手术治疗。此外，克罗恩病可能合并有贫血的症状，病人可能出现乏力、精神萎靡的症状。除此之外，克罗恩病还会伴有一些肠道外的症状，比如关节炎。