对于灰指甲的治疗，一般是采用口服的药物，口服的药物可以到达指甲的末端。因为抗真菌药物的靶点就是和角质蛋白相结合，而头发、皮肤、指甲都是由角质蛋白构成，所以口服抗真菌药可以治疗体癣、头癣和甲癣。药物在治疗灰指甲的过程中，对于已经发生病变的指甲，没有任何治疗作用。但是能够抑制和杀灭真菌，从而使长出来的新指甲是好的，逐渐代替病变的指甲，这就是一个治疗的过程。因此，患者需要先去医院做指甲的真菌显微镜下的检查，确诊是属于灰指甲的病变，然后医生会开具相应的药物。治疗的疗程比较长，治疗要有耐心。手指甲大概需要12周的时间，脚趾甲大概需要16周的时间。在治疗当中，会看到新生指甲逐渐代替发生病变的指甲，直到完全代替，疗程就完成了。