金黄色葡萄球菌的感染，如果治疗方法得当，治疗的疗程足够，大多数患者可以根治，常见的包括以下几种：1、 皮肤软组织的感染：如果小的疖肿直径＜5cm，或者甲沟炎，脓肿可以自行穿破或通过引流，一般绝大多数可以治愈，而且不需要应用抗菌药物治疗。但如果有发热，脓肿直径＞5cm，一般需要切开引流，同时还需要应用抗菌药物治疗，疗程足够，一般也可以治愈；2、深部的脓肿：比如一些脓肿引起了侵袭的病灶，出现肺脓肿、脓胸或者脑脓肿，一般需要切开引流，同时应用全身的抗感染治疗，疗程足够，一般也能够根治；3、深静脉内置的导管或者人工的瓣膜：如果是深静脉内置的导管或者人工的瓣膜，引起金黄色葡萄球菌的感染，这种情况下单用抗菌药物治疗，一般不能够根治，需要拔除深置的导管以及人工的瓣膜。这种情况下，如果没有采取拔除置管这种措施，单用抗菌药物就很难根治。另外感染性心内膜炎出现了局部的脓肿、栓塞以及穿孔，或者出现心力衰竭，这种情况下往往需要外科手术治疗，否则也很难根治；4、骨髓炎：金黄色葡萄球菌引起播散性的骨髓炎，一般也需要外科首先去除死骨以及坏死组织，再配合抗菌药物治疗，否则单纯应用药物治疗，也很难根治。