亚甲炎头痛很厉害，其实主要是亚甲炎为病毒感染，即类似于自身抵抗力下降，病毒感染后，引起机体内反应。因为病毒感染后，患者经常可能会出现低热、全身酸痛，受低热影响，部分患者可能就出现头痛，这就是发热后可能会头痛得较厉害、引起头痛的原因。当然，亚甲炎另外也可能会引起头痛，主要还是与其造成一过性的甲状腺破坏有关。因为出现亚甲炎时，实际上即抗体落在甲状腺上，将甲状腺正常组织破坏以后，甲状腺中的部分激素都要入血，入血后就会引起类似于甲亢的表现。部分患者甲亢时，可能也会出现头痛，包括乏力、亢奋，可能会精神高度紧张，也会存在头痛加重的趋势。所以，亚甲炎实际上引起头痛厉害的原因，可能与低热有关，因为病毒感染，患者可能体温比正常人稍高，而部分患者较敏感就可能出现头痛。另外，即可能因为亚甲炎导致甲状腺组织破坏，甲状腺激素入血后引起类似于甲亢的表现，实际上也会加重头痛。所以很多患者可能在患亚甲炎时，就会出现头痛的感觉，甚至可能会疼痛较厉害。