新生儿心肌炎相对较少见，见于新生儿病房或在社会上发生肠道病毒的流行，引起新生儿病毒性的心肌损伤，常见有柯萨奇病毒、埃可病毒等肠道病毒的传染或流行。​我国也发生过类似的病毒传染，病毒传染后，引起了新生儿心肌炎的改变。表现为新生儿心电图的异常、心肌酶增加、酶谱升高等，可能还会伴有严重的心功能问题。心脏扩大、射血分数减低、左心室的短轴缩短率下降、心肌、心室的矛盾运动、心力衰竭，甚至心源性休克、窦房结出现问题等，均属于较为严重的感染后心肌炎并发症。包括心肌的电学改变、酶学改变、影像学改变、超声改变、大小改变，需要及时加以干预，进行抗病毒治疗、营养心肌治疗。若出现三度房室传导阻滞或窦房结功能异常，可能还需要安装起搏器，如临时起搏器等。