孕12周有褐色的分泌物，要分以下3个方面来讲，具体分析如下：1、最常见的是有先兆流产，如果是先兆流产，要给予保胎治疗，最常用的有黄体酮、保胎类的中成药；2、要检查宫颈有没有宫颈息肉、宫颈癌前病变、宫颈炎症，也可以导致褐色分泌物；3、阴道B超查看有没有胎盘的前置状态，因为胎盘的前置状态或者有剖宫产史、做过试管婴儿，导致胎盘种植在子宫的下段，甚至偏宫颈的地方，导致低置胎盘，也可能有褐色的分泌物；4、还有一些比较少见比如胎盘后绒毛膜下血肿或者其他别的原因，如比较重的炎症等，都可以有褐色的分泌物。总体而言需要个体化的处理，要及时就诊进行甄别。