眼睛酸痛流泪，最常见的两种疾病如下：1、结膜炎：最常见的是过敏性结膜炎，由于眼睛对某些物质过敏，致敏物质对眼睛刺激以后，会形成过敏性结膜炎。过敏性结膜炎会导致眼睛充血、发红、流泪，有时会有疼痛感；2、角膜炎：不管是角膜发生了外伤，或者角膜产生炎症，会导致角膜表面上皮损伤，明显的症状是酸疼，刺激性流泪。角膜表面有大量丰富的神经，角膜产生炎症时，容易刺激对眼睛的感觉，这种疼痛和酸痛的感觉，就比较明显。同时有一种疼痛的刺激，会导致反射性流泪。眼睛有时会怕光，睁开眼睛时，光线刺激时有疼痛或者流泪的感觉。