颈部两侧出现疼痛的原因较复杂，具体原因如下：1、颈椎疾病：颈椎曲度变直、反弓，或者椎间盘退变、膨出、突出等，都会导致脖子两侧疼痛；2、肌肉疾病：如果颈后部肌肉长期处于收缩状态，如低头较多时会导致肌肉劳损，从而引起颈后部肌肉出现酸、胀、麻、痛等症状；3、风湿免疫疾病：如强直性脊柱炎等，也会导致颈后部及两侧出现疼痛；4、肩关节疾病：不仅会引起肩周疼痛，还会蔓延至颈部周围，从而引起颈部疼痛。引起颈部两侧疼痛的原因较多，建议到医院进一步检查，才能明确原因并予以治疗。