新生儿心脏有杂音可能是生理原因，也可能是病理原因，具体如下：1、生理原因：不是所有心脏杂音都是先天性心脏病，也有些是生理性杂音，如卵圆孔未闭属于生理性状态，随着年龄增大会逐渐关闭，偶然开放出现杂音不需要过于焦虑，属于生理性状态；2、病理原因：一般与心脏结构或大血管结构有问题，出现不正常的心脏声音有关，可能与先天性心脏病关系比较密切。多数心脏杂音可能与心脏的异常结构有关，如杂音出现在二尖瓣部位、心尖部位、三尖瓣部位。此种杂音的性质，也可分为收缩期杂音和舒张期杂音，不同时期的杂音或不同部位的杂音，都会提示不同的心脏问题。如果出现心脏杂音，可以适当进行超声心动检测，检查心脏结构是否存在问题。如果确实存在问题，应及时进行干预和处理。如果是生理性杂音，超声心动检测正常，就可以安心。