宝宝阴茎短小的原因包括： 1、生理因素：有些男孩在出生的时候比较胖，且在幼儿成长期由于营养过剩，导致腹部脂肪堆积，出现阴茎外观不良，看似有阴茎发育短小的问题。这种情况可以通过控制体重、适当加强锻炼进行改善，继而能使阴茎的发育自然得符合年龄预期； 2、病理因素：性腺功能减退导致真性的阴茎发育短小，一般见于某些有遗传或者内分泌异常的儿童，如染色体病的遗传、内分泌的失调，可导致机体激素失衡，使外生殖器发育过程中出现紊乱或者障碍。有这类问题的儿童，在幼儿期他们的阴茎发育和同龄期孩子相比，可出现过小或者过短的情况，故家长一定要带患儿到正规的专科医院或者儿童医院做相关检查，辨别是由于后天营养导致得阴茎发育问题，还是由先天因素导致的阴茎短小。