细菌性肝脓肿，并不是说都一定会出现腹痛的症状。某些早期的肝脓肿可能主要表现是畏冷、寒战、高热，患者往往会把它当成呼吸道感染肺炎来进行诊治。而只有当肝脏的脓肿比较大引起的肝脏的肿大，会引起包膜的急性的膨胀，才会引起肝区的疼痛感。这种疼痛感在早期主要是以持续性的钝痛为主，如果发展到后期，也可能会出现急性的锐性的疼痛。如果是位于膈顶的脓肿，有可能会随着呼吸而出现疼痛的症状。某些在右肝的脓肿，也有可能会出现右肩部的放射性的疼痛，而左肝的脓肿也有可能会出现左肩部的放射性的疼痛。在疼痛出现的情况下，也有可能会伴随着一些其它的症状，比如消化道的症状，腹泻、腹胀、恶心、呕吐、食欲减退等。另外，如果肝脓肿感染比较严重，引起的严重的脓毒血症、败血症，不仅会出现畏冷、寒战、高热等炎症反应，甚至严重的还会引起部分感染性的休克的表现，出现血压下降、心率加快的情况。