胃肠道间质瘤的手术指征，通常的评估标准是以2cm作为评估的界限，也就是患者如果发现胃肠道间质瘤在2cm以上，没有明显的远处转移，能够切除干净的情况下，要选择手术治疗，主要分析如下：1、胃底、大弯侧及前壁的外生型胃肠道间质瘤：可以采取楔形切除，或者是胃部分切除术；2、胃底、大弯侧以及前壁的内生型胃肠道间质瘤：可以采取胃浆肌层切开GIST切除术，或者是胃部分切除术；3、胃小弯侧的GIST：可以采取胃壁全层切开的胃肠道间质瘤切除术，以及胃部分切除术；4、外生型、黏膜面无溃疡的胃肠道间质瘤：包括一些特殊部位的，比如位于食管胃结合部或者是幽门的胃肠道间质瘤，可以采取保留黏膜的胃GIST切除术，或者是胃部分切除术；5、位于2-5cm无危险因素的胃肠道间质瘤：手术完整切除术能够达到治愈的状态，约85%的原发肿瘤患者，有可能会被完整切除。