肱骨髁上骨折最容易出现的晚期并发症是肱骨肘关节部位肘内翻畸形。肱骨髁上骨折是比较常见的肘关节周围骨折的一种类型，特别在青少年发生骨折后，很容易出现晚期肘内翻，提携角消失，手远端往内侧倾斜的畸形。因此肱骨髁上骨折早期容易发生肘关节周围尺神经、桡神经、正中神经等神经损伤，也容易导致肘关节前方的肱动脉、肱静脉血管损伤。有可能出现肘关节周围的肌肉挛缩、缺血、骨折不愈合、畸形愈合等并发症。在这些并发症当中最容易出现的晚期并发症是肘内翻畸形，有很多小孩摔倒后，发生肱骨髁上骨折，通过手法复位，夹板、石膏固定达到骨折愈合，但是将来可能会出现肘内翻的情况。