慢性咽炎引起的舌根滤泡增生的治疗主要是采用药物治疗，引起慢性咽炎舌根滤泡增生的主要原因是咽喉反流，由于长期的咽喉反流刺激，会引起舌根滤泡增生。在治疗上主要是采用药物治疗，常用的包括抑酸药，比如雷贝拉唑、奥美拉唑、泮托拉唑等质子泵抑制剂。还要口服胃肠动力药，比如枸橼酸莫沙必利、吗丁啉等。另外也要配合治疗慢性咽喉炎的中成药，比如丹参酮胶囊、肿痛安胶囊等。如果患者慢性咽炎造成的舌根滤泡增生比较严重，引起了睡眠-呼吸暂停综合征，这种情况可以尝试用低温等离子，在黏膜下烧灼滤泡，使其缩小，这样可以缓解上呼吸道梗阻的情况。还有一部分患者是由于经常有急性炎症，如急性上呼吸道感染、急性咽炎，这些急性炎症反复发作，也会造成滤泡增生，这种情况就要加强身体锻炼，减少急性炎症的发生率。