目前没有很好的方法来帮助巧克力囊肿彻底不复发，除非进行双侧的卵巢切除。如果卵巢切除以后，不再有雌激素分泌，卵巢囊肿就不会再复发，但是这是非常极端的情况。因为卵巢巧克力囊肿是良性的疾病，所以不能因为良性的疾病就进行卵巢的切除。卵巢切除以后，女性就会缺乏激素的分泌。所以目前为止还没有方法可以很好地控制卵巢囊肿的复发，卵巢巧克力囊肿又称为子宫内膜异位囊肿，它是一种女性较为常见的妇科疾病，可能会造成很多的不良后果，比如女性会出现严重的痛经，会导致盆腔的粘连，引起不孕症。巧克力囊肿还会出现破裂，引起急性腹痛，甚至有时需要急诊手术来进行治疗。对于卵巢巧克力囊肿的治疗，可以分为保守性的药物治疗和手术治疗，药物治疗主要起的作用也是控制卵巢巧克力囊肿的增长，避免生长过快需要手术，但是也不能起到彻底治疗的作用。而手术治疗主要是采取巧克力囊肿剥除术，也不会使得卵巢功能丢失。另外还要尽量保护卵巢功能，所以在术后仍然有复发的可能性。