检查生殖器疱疹有三个方法。具体内容如下：1、肉眼观察：比较常见的是医生根据临床经验和肉眼的检查，再结合病人有没有接触史或者既往发作史和好发部位，男性一般是在阴茎或者阴囊上，女性好发部位多在阴唇上，呈现一些散在成熟的小水疱，红斑的丘疹水疱，甚至可以糜烂；2、抽血化验：主要是单纯疱疹，一型和二型或者病毒性的抗体，如果有抗体，则为IgG抗体或者IgM抗体， IgM抗体是急性感染，IgM抗体为阳性，既往有生殖器疱疹发作病史，是疱疹的抗体检查；3、病理检查：用波片刮出水疱底下的糜烂面，通过做Tzanck细胞检查，可以观察病毒包涵体上面有疱疹病毒，感染后及皮肤的增生，对病毒包涵体诊断，是对生殖器疱疹比较完整的诊断。