食脑虫感染后首先会引发鼻咽部症状，如咽痛和鼻塞流涕等。之后，食脑虫会沿嗅神经侵入脑部，破坏脑部各区，并出现喷射状呕吐、头痛、嗅觉异常等症状。随着病情发展，体温会逐渐升高，由开始的低烧发展为39～40℃高烧，并出现癫痫、瘫痪等症状，甚至出现昏迷。感染者一般在出现症状后的1至18天内出现严重的脑水肿，从而导致呼吸、循环中枢衰竭，最终死亡。
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