艾灸的科学原理主要包括以下三个方面：

1. 艾叶的中药特性：艾灸主要使用艾叶制成的艾条、艾柱，通过燃烧产生近红外线和热量，刺激人体穴位或特定部位，以达到防病、治病的目的。艾叶性温热，内服或外用都有温通经脉、振奋阳气的作用，这是艾灸治疗的基础。
2. 经络理论的应用：艾灸在治疗疾病时，常会用到经络理论。例如，胃脘部的不适常灸足三里穴，因为足阳明胃经循行过腹部，而足三里穴是足阳明胃经的重要穴位，也是胃的下合穴，有治疗胃脘疾病的功效。
3. 脏腑理论的影响：一些疾病，如遗精、泄泻、遗尿等疾病，通过中医辨证提示属于脾阳虚或肾阳虚。在艾灸治疗时，就会选择脾肾脏腑对应的经络进行选穴治疗。

总的来说，艾灸的原理是利用艾叶的温热性质结合经络理论，通过刺激人体穴位和特定部位，产生近红外线和热量，达到调节人体气血、祛除寒湿、平衡阴阳等效果，以预防和治疗疾病。同时，艾灸也可以根据不同人的身体情况和不同的穴位，使用不同的施灸方法和手法，以达到个性化的治疗效果。