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无痛肠镜检查，患者一般处于昏睡状态，因此不会产生不适和痛苦。无痛肠镜检查主要用于诊断结肠的炎症性肠病，以及肿瘤、出血、息肉等，并可行切除息肉、止血治疗。主要用于原因不明的慢性腹泻、便血及下腹疼痛，疑有结肠、直肠末端回肠病变者，钡剂灌肠有可疑病变，需要进一步明确诊断的患者，炎症性肠病的诊断和随访。另外，结肠癌术前诊断、术后随访、息肉摘除术后观察随访，都需要进行结肠镜检查。需要做止血和结肠息肉摘除的患者，需要进行结肠镜检查。大肠肿瘤普查的情况，也需要进行结肠镜检查。
有以下情况的时候禁忌做肠镜，例如存在严重的心肺功能不全、休克和精神疾病的患者，或者急性弥漫性腹膜炎、腹腔脏器穿孔、多次腹腔手术、腹内广泛的粘连和大量腹水的患者，或者是肛门直肠严重狭窄的患者，以及急性重症结肠炎，如细菌性痢疾、重度溃疡性结肠炎及憩室炎等，还有妊娠妇女，这些患者不能进行无痛肠镜检查，所以进行无痛肠镜检查，需要把握其适应证。
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