一侧肾区疼痛的原因主要包括以下几种：1、泌尿系统疾病：建议患者进行泌尿系统排查，如通过泌尿系统B超检测明确是否存在肾脏疾病，如常见的肾脏结石、肾脏积水，甚至肾脏肿瘤以及感染性病变，如肾盂肾炎，上述疾病均可导致一侧肾区疼痛；2、肝胆系统疾病：因为内脏疼痛定位并不准确，肾区疼痛不一定是肾脏本身疾病所引起，所以应进行详细排查。通常腹腔其他器官的病变，如右侧肝胆系统疾病，也可导致患者出现右肾区疼痛；3、其他疾病：部分骨科疾病、腰椎局部肌肉劳损，也可导致患者出现一侧肾区疼痛。