膝关节囊肿患者的治疗方法如下：1、保守治疗：如果囊肿比较小，对关节不会造成太大影响，患者没有疼痛的症状，可以采取保守治疗。主要针对膝骨关节炎进行治疗，应注意保暖，避免过多的爬楼、爬山，多做直腿抬高训练，适当服用非甾体类抗炎药，减少关节渗出，可以使囊肿大小得到控制，从而能够使关节功能得到较好保护；2、手术治疗：如果关节囊肿比较大，影响关节的屈伸活动，患者可以采取手术方法，彻底切除囊肿。但是由于膝骨关节炎的病因仍然存在，有时会出现囊肿再发。对于较小的囊肿，也可以采取穿刺抽出囊液的方法，但是容易复发。膝关节囊肿常发生于腘窝处，即膝关节后方，常由于骨关节炎造成滑液渗出过多，积聚在关节后方，从而形成贝壳囊肿，可影响关节活动度。关节囊肿的治疗较复杂，虽然是简单良性的囊肿样病变，主要与骨关节炎有密切关系，因此治疗应与骨关节炎治疗结合。