长期脖子酸痛的原因较多，常见原因如下：1、颈椎病：长期不良习惯或者伏案工作时间过长，会造成椎间盘突出、骨质增生，导致颈椎病发生，出现脖子酸痛症状；2、炎症：局部炎症或者免疫性因素造成炎症刺激，出现结缔组织或者肌肉病变，这种情况需要检查肌酶或者查血液免疫指标明确诊断；3、神经病变：如脊髓病变、脊髓炎或者缺乏维生素B12，造成颈部神经受到损害，表现为颈部酸痛症状，需要通过颈部磁共振检查，明确是否存在脊髓神经变性，给予对应治疗，如补充维生素B12、维生素B1等，同时可通过对症治疗改善症状。