卵巢囊肿的病因不同，治疗方案也不同，卵巢囊肿的原因与治疗有以下几种：1、生理性囊肿：卵巢上的卵泡或者黄体没有及时衰退会形成囊肿，但不是肿瘤，通常不需要手术和药物治疗，观察即可，2-3次月经后，多数囊肿可以消除，消除后就不存在异常；2、良性肿瘤：包括畸胎瘤、巧克力囊肿，都需要进行手术，将异常的囊肿组织剔除，保留良好的组织即可；3、恶性肿瘤：包括卵巢癌，这种情况手术的范围不仅是切除卵巢，很可能需要切除子宫，甚至需要更广泛的手术清除才能将病灶完全清除。