喝酸奶治便秘与喝酸奶的时间应不存在直接关系，喝酸奶可以治疗便秘主要是因为酸奶中含有部分有益菌，有益菌进到肠道后，可能改善肠道微生态的环境，影响到肠道内的pH值和渗透压等，有利于部分胃肠激素的分泌和增加胃肠蠕动的能力，从而促进排便。同时由于酸奶含有经过发酵的蛋白质等，而部分人可能对发酵过的蛋白质有一定的敏感，进入肠腔后引起肠道反应，出现肠蠕动的加快，因此喝酸奶治疗便秘，何时喝都可以。此外清晨时更容易排便，若患者想达到更好的效果，可以尝试清晨起床后喝酸奶，可能作用会更加明显。但最重要的是需要长期坚持，喝1-2次无法达到治疗便秘的作用，除非患者对酸奶中某些成分过敏，食用后可能很快产生排泄反应。