陕西株GBV-C/HGV RNA NS3区cDNA的序列分析

　　应用反转录及套式PCR 技术， 从陕西省西安市两位非甲～戊型急性肝炎患者的血清中提取RNA，经特异性的反转录引物P4反转录成cDNA ，以此为模板分别用P3，P4及P1，P2两对引物进行PCR扩增，扩增到218bp（4248nt～4465nt ）的HGV RNA NS3区部分基因，将其克隆人PinPointTMXal-T载体，挑选阳性克隆并进行了序列分析，结果表明SG2与HGV的核苷酸同源性分别为85.64％与84.48％；与GBV-C 的核苷酸同源性为86.21％与84.48％，其二者之间的核苷酸同源性为97.13%，二者与HGV的氨基酸的同源性分别为98.28%和93.10%，与GBV-C的氨基酸同源性为98.28%，93.10%，二者之间的氨基酸同源性则达到了94.83％。 通过与汪太兴等人分离出的序列结果进行比较，我们认为来自于同一地理区域的分离株往往同源性较高。另一方面，结果也提示了国内各省区之间病毒株的变异。通过对核苷酸突变和氨基酸同义突变情况的分析来看，同义突变率均在80％以上，且分布比较均匀。同时我们从SG2，SG3与HGV，GBV-C的较高的氨基酸同源性（98.28 ％、93.10％）可以看出，HGV基因组的变异率要比HCV低得多， 其蛋白序列则更为保守，它很可能是一种对其生活环境（即人体）更为适应的病毒。有关GBV-C/HGV 的许多问题尚待探索，陕西株部分HGV/GBV-C的核苷酸序列分析， 将对今后HGV/GBV-C的分子生物学研究以及诊断试剂的研制有一定参考意义。