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新生儿外科、小儿普外科、小儿微创腔镜外科，有较丰富的临床经验和较深的学术造诣，尤其是小儿肠梗阻、小儿疝气、小儿肠套叠、小儿尿道下裂、小儿隐睾症、先天性肛门闭锁、新生儿脐疝等疾病。
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- 小儿腹股沟疝、疝气、鞘膜积液、肝胆疾病，如先天性胆管扩张症、胆道闭锁，以及腹部肿物，如体表肿物、淋巴管瘤、血管瘤、腹腔内各种肿瘤的诊治，专长应用腹腔镜实施微创手术，并擅长治疗小儿骨折、尿道下裂、肠套叠、肠梗阻、膝关节畸形等疾病。
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- 腹股沟斜疝、鞘膜积液、体表肿块、甲状舌管囊肿、腹部肿瘤、肝胆胰疾病等小儿常见和疑难外科疾病的诊治，包括肝脏肿瘤、腹部神经母细胞瘤、肾母细胞瘤、畸胎瘤、骶尾部肿瘤、横纹肌肉瘤、血管瘤、淋巴管瘤、胆囊胆管结石、胆道闭锁、胃肠道畸形、小儿急腹症等。还擅长应用腹腔镜微创技术，包括腹股沟斜疝、鞘膜积液、小儿急性阑尾炎、腹股沟嵌顿疝、卵巢肿瘤、腹部肿瘤，及消化道穿孔、急性肠梗阻、腹膜炎、脑肿瘤、脑积水、疝气、肠套叠、尿道下裂等的治疗。
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- 小儿微创手术治疗及儿童医学美容外科治疗，如腹股沟斜疝、鞘膜积液、体表肿物、腹腔肿物、颌面部包块、淋巴管瘤、血管瘤等。同时擅长儿童肝胆及各类难治性恶性肿瘤手术，如先天性胆管扩张症（胆总管囊肿）、胆道闭锁、梗阻性黄疸、肝母细胞瘤、肾母细胞瘤、神经母细胞瘤、畸胎瘤、骶尾部肿瘤、孕产期胎儿保健及胎儿疾病咨询等。
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- 诊治小儿普外科疾病，如胃肠道先天畸形（美克尔憩室、肠重复畸形等）、肝胆胰疾患（先天性胆管扩张、胆道闭锁、胰腺肿瘤等）、儿童体表及腹部良恶性肿瘤、疝气、鞘膜积液、阑尾炎、血管瘤、淋巴管瘤、肠套叠、肠梗阻、尿道下裂、房室传导阻滞等。近年更专注于腹腔镜微创治疗腹腔疾患及药物注射治疗血管瘤、淋巴管瘤。
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- 熟练运用腹腔镜及常规手术技术治疗小儿普外及胃肠新生儿外科各种疾病，如先天性巨结肠、肠闭锁、肛门闭锁、环状胰腺、肠旋转不良、新生儿坏死性小肠结肠炎、先天性幽门肥厚性狭窄、甲状舌管囊肿、阑尾炎、肠憩室切除、腹股沟斜疝、小儿疝气、肠套叠、肠梗阻等。
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小儿肿瘤、肝、胆及消化道疾病的诊治，应用小儿腹腔镜、结肠镜对小儿外科疾病的治疗，对小儿疝气、小儿肠套叠、小儿尿道下裂、小儿隐睾症、先天性直肠肛管畸形、先天性肛门闭锁、先天性胆道闭锁、新生儿脐疝、胎粪性肠梗阻等疾病拥有丰富的诊疗经验。
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- 治疗肠道畸形，如梅克尔憩室（美克尔憩室）、肠重复畸形、肠旋转不良、肠梗阻、肠套叠等，以及肠闭锁、坏死性小肠结肠炎、消化道穿孔、膈疝、脐膨出、先天性肥厚性幽门狭窄、骶尾部畸胎瘤、卵巢囊肿等。还擅长治疗肛门直肠畸形，如先天性肛门闭锁、肛门前移、直肠舟状窝瘘、肛门狭窄、肛裂、便血、肛周脓肿、肛瘘等，以及器质性便秘、慢性便秘、先天性巨结肠等。还擅长治疗腹盆腔肿瘤、畸胎瘤、囊肿、腹腔淋巴管瘤、卵巢囊肿或畸胎瘤，以及微创治疗腹股沟斜疝、小儿疝气、鞘膜积液、脐疝等。
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- 小儿泌尿生殖系统先天畸形、泌尿系统感染及各种泌尿生殖系疑难重症的诊断及治疗，包括肾积水，膀胱输尿管返流，重复肾畸形，先天性发育不良肾，尿道下裂，隐匿性阴茎，阴茎下弯以及睾丸下降不全等。擅长微创治疗，利用腹腔镜，膀胱镜等进行微创手术，包括腹腔镜肾盂成形术，腹腔镜输尿管再植术，腹腔镜重复肾（或发育不良肾）切除术等，熟悉多学科结合，包括产前诊断、产科及小儿泌尿外科联合诊治。
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- 运用纯中药结合小儿推拿治疗小儿外感发热、咳嗽、厌食、过敏性鼻炎、鼻窦炎及小儿过敏性疾病；对妇科、消化科疾病亦有一定临床经验；黄仁忠医生提倡纯中药治疗小儿外感发热，疗效凸出，使儿童能有效避免抗生素滥用。
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- 小儿普外科常见疾病，包括体表包块、肠套叠、腹股沟斜疝、鞘膜积液、阑尾炎、肠炎、肠梗阻、胆囊结石、先天性胆管扩张症、胆总管囊肿、胆道闭锁及小儿腹腔肿瘤等，应用微创技术治疗腹股沟斜疝、鞘膜积液、阑尾炎、腹腔囊肿等常见腹腔疾病。
