东莞市石碣医院是石碣镇唯一的一所集临床、预防、教学、科研于一体，二级规模的现代化综合性公立医院。医院前身是石碣卫生院，建于1958年，石碣新医院于2000年4月建成使用，现任院长刘小红，党总支书记钟向阳，副院长刘仲文，副院长招建华。

新医院建筑面积2.8万平方米，主体建筑有门诊楼、住院楼、影像楼、后勤综合楼。行政部门有办公室、总务股、护理部、医务办、党办、纪检办、人力资源办、财务办、绩效办、医保物价办、二甲办、院感办、质控办、科教办、设备办、信息办、安全办、医患办、健康服务中心。科室有门诊、急诊科、ICU、内一科、内二科、儿科、妇产科、普外科（泌尿外科）、骨科、神经外科、手外科、麻醉科、中医科、康复医学科、口腔科、眼科、耳鼻喉科、皮肤科、体检科、检验科、放射科、超声科、病理科、供应室、高压氧、药剂科、东聚医务室。在职人员561人，其中专业技术人员506人，高级职称82人，中级职称158人，退休职工62人。

东莞市石碣医院拥有德国西门子1.5T超导磁共振（MRI）、荷兰飞利浦Briliance 16排螺旋CT、飞利浦数字化直接成像系统DR、美国GE Brivo OEC715移动式C型臂X线机、上海联影uDR370i移动X线摄影系统、美亚光电三维数字化口腔CT、韩国三星麦迪逊UGEO WS80A 5D高端四维超声诊断系统、美国GE 730高档四维彩超及飞利浦IE33进口心脏彩超、钬激光治疗仪、艾克瑞多功能DR体检车、德国莱卡OPMI Vario S88手术显微镜、德国卡尔史托斯腹腔镜系统、日本奥林巴斯电子胃肠镜系统、德国罗氏Cobas 8000全自动生化分析仪、日本希森美康全自动五分类血液分析仪等一系列先进设备。

东莞市石碣医院的骨科、神经外科、手外科、妇产科为重点专科，口腔科、眼科为我院特色专科，具有多名高级职称的医务人员，并且和中山大学附一院、中山大学附二院、中山大学附三院、南方医院、珠江医院、广东省中医院、广州市第一人民医院等多家广州三甲医院保持业务上的合作。医院成功地开展了一些疑难病症的治疗：如颅内出血微创手术、颈椎骨折切开复位内固定术、腰椎骨折复位内固定术、全髋、膝关节置换术、关节镜手术、微创接骨技术、断肢再植、手指再造术、手部畸形矫形术、恶性卵巢肿瘤根治术、人工晶体植入术、宫腔镜手术诊疗、盆底康复治疗、急性脑梗塞溶栓治疗，救治极低体重儿等。目前医院实际设有病床284张，定编病床355张。

东莞市石碣医院被评为全国三八红旗集体、全国巾帼文明示范岗、全国亿万农民健康促进行动示范区、国家卫生镇、广东省百家文明医院、东莞市文化建设标兵医院、东莞市文明标兵单位、东莞市园林式单位，东莞市儿童口腔疾病综合干预项目优秀实施单位，急诊科注射室、西药房、口腔科、神经外科护理组为东莞市青年文明号，多次被石碣镇评为先进单位。全国爱婴医院、广东省中医院协作医院、广东省普通高等医学院校教学医院、广东省全科医师培训基地、广东药学院教学基地、广东省职业健康检查机构、广东省无烟单位、广东省健康促进示范医院、东莞市石碣医院社区卫生服务中心医疗联合体、东莞市人民医院石碣医院医疗联合体、骨科被评为东莞市临床特色专科。