南京鼓楼医院集团仪征医院始建于1978年，前身是中国石化仪征化纤职工医院，1991年成为南京医科大学第三附属医院，2004年完成第一次改制，2012年二次改制，加入金陵药业股份有限公司，加盟于南京鼓楼医院集团，更名为“南京鼓楼医院集团仪征医院”。在鼓楼医院的大力帮扶下，医院综合实力显着提升，医教研协同发展。于2019年，医院与高校再度合作，成为扬州大学医学院附属医院。

1994年，医院通过国家二级甲等医院验收；1995年通过国家爱婴医院验收；2018年，医院召开创建三级医院动员大会，开启全面发展新征程，计划到2022年，通过评审成为三级综合医院。

医院占地5万平方米，建筑面积8万平方米，现有在岗职工约1000人，其中卫技人员近750人，中高级职称近300人；临床医生约260人，护士约390人，南京鼓楼医院长期派驻专家30余人，心内科、肿瘤科、神经内科等10多个专科与鼓楼医院建立帮扶和业务协作关系。

医院设临床、医技科室31个，其中儿科、呼吸内科、神经内科、消化内科、普外科、妇产科、麻醉科、心内科、医学检验科、肿瘤科、内分泌科、医学影像科、胸心外科、神经外科共14个专科为扬州市市级临床重点专科。

二次改制以来，医院开展各种新技术新项目140余项，主要包括房间隔缺损封堵术、超声引导腹横肌平面阻滞技术在腔镜下胆总管切开取石手术后镇痛的应用、缺血性脑血管病的支架植入治疗等，多项技术填补了仪征地区的空白。

医院先后成立了“DSA介入诊疗中心”“创伤救治中心”“消化内镜诊疗中心”“仪征市危重孕产妇和新生儿救治分中心”“中国卒中中心联盟成员单位”“南京鼓楼医院脑病中心仪征分中心”“南京鼓楼医院肿瘤中心仪征分中心”“南京鼓楼医院肿瘤多学科远程会诊中心仪征医院分中心”以及“心血管病中心”，通过评审已创建成为“江苏省防治卒中中心”“江苏省癌痛规范化治疗病房”。先后加入苏北人民医院医疗集团“骨科”“脑卒中”等联盟，是“扬州市胸痛中心联盟副理事长单位”。目前，呼吸与危重症医学科PCCM规范化建设项目已通过线上评审认证，胸痛中心创建工作正按计划积极推进。

医院设立有院内科研项目专项基金，充分调动了广大职工开展科研的积极性。近年5年共获得扬州医学新技术引进一、二、三等奖6项，2021年获批2020年度省中医药科技发展计划项目立项1项。

2013年，医院成为扬州大学医学院教学医院，目前承担了扬州大学医学院临床专业以及宣城职业技术学院、江苏健康职业学院、扬州职大等院校护理专业的实习带教工作，曾承担南京医科大学部分学生理论授课、武汉科技大学临床专业实习带教工作。

2015年，医院成为扬州大学附属医院住院医师规范化培训基地协同单位，连续多年被评为扬州大学附属医院“优秀协同培训单位”，并多次荣获指导老师讲课竞赛、参赛课件等奖项。

2021年4月，在扬州大学主办的临床教学基地教学查房竞赛中，我院与各大三级医疗机构同台竞技，荣获临床教学基地教学查房竞赛中青年教师组一等奖、高级职称组竞赛三等奖。