小便时尿道疼痛是典型的尿道炎的表现，由于尿道外口周边的细菌，如大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、异型杆菌等，沿着尿道外口侵入尿道至膀胱的黏膜上皮。细菌会在这些黏膜上皮的表面定植，导致尿路黏膜充血、水肿、肿胀，感觉神经外露，会造成尿频、尿急、尿痛的感觉。特别是在排尿时，尿液流经已经炎症肿胀的尿道部分，就会造成小便的时候尿道疼痛。由于是一种细菌感染所致的疾病，通常推荐使用喹诺酮类抗生素或者头孢类抗生素进行治疗。喹诺酮类抗生素一般首选左氧氟沙星，但是对于妊娠期、哺乳期、<18岁者，禁止使用喹诺酮类抗生素，会影响骨骼的生长发育。如果对青霉素和头孢不过敏，可以选择头孢类抗生素，一般治疗7天左右，患者就会有很好的改善，小便也不再疼痛。