阴茎里边刺痛最常见于尿道炎。患者发生淋菌性尿道炎或非淋菌性尿道炎时，由于感染性致病菌刺激尿道黏膜，会出现黏膜红肿、糜烂，出现黏膜水疱、脓疱现象。水疱、脓疱破裂后形成分泌物，排尿时或不排尿时都会出现局部刺痛症状，也会出现尿道外口分泌物，部分患者还会出现尿道发痒症状。患者出现阴茎里面刺痛症状时，需及时到泌尿外科就医，通过尿道分泌物检查常常能找到致病微生物，通过选择有效的抗生素，如阿奇霉素分散片、盐酸多西环素胶囊、盐酸米诺环素胶囊、磷霉素氨丁三醇散等药物，序贯治疗4-6周，多数患者阴茎里面刺痛症状会明显好转。治疗期间需消毒内裤，不能同房。