跑步后尿液呈咖啡色属于异常现象，常见原因如下： 1、运动性血尿：即经过大量运动后出现尿血症状，目前运动性血尿出现机制尚未明确。患者在进行详细检查后，未发现泌尿系统肿瘤、结石等疾病，且血尿与运动相关联，故可诊断为运动性血尿，多数患者无需进行处理； 2、泌尿系统结石：患者在活动过程中结石位置发生变化，可导致输尿管黏膜划伤，从而出现血尿。此时可根据结石大小、位置、形态及一侧肾脏功能情况，进一步判断采取排石治疗、体外冲击波碎石治疗、输尿管镜激光治疗或者手术治疗。