IgA肾病的发病机制目前不是特别明确，但医学界广泛认为，IgA肾病的发病与黏膜免疫有关，通常是由黏膜感染引起，比如上呼吸道感染、泌尿系感染以及肠道感染。IgA肾病患者在黏膜感染后，体内会产生糖基化异常的IgA，如果不能被免疫系统清除，就会沉积到肾脏的肾小球系膜区，最终会导致激活补体，引发肾脏疾病，比如血尿、蛋白尿等尿检异常。临床上有些患者会在上呼吸道感染以后，反复出现肉眼血尿，或上呼吸道感染以后，出现血尿和蛋白尿加重。因此患者如果由反复的扁桃体感染引发，建议切除反复感染的扁桃体。此外，用肠道释放的布地奈德治疗IgA肾病，也是目前IgA新的治疗方法中的一种，