囊肿的治疗方法需要结合囊肿在肾脏中的位置、囊肿大小以及囊肿数量，可以选择腹腔镜或者经皮穿刺硬化等，具体如下：1、腹腔镜手术：如果囊肿靠近肾脏外周、腰部，这时可以选择腹腔镜手术，能够获得比较好的治疗效果，通过腹腔镜微创手术，可以切除大部分囊壁来得到治疗。如果囊肿靠近腹部或者肾脏内部，也建议患者尽可能选用腹腔镜手术，因为囊肿穿刺可能会损伤到肠道或者肾脏。如果囊肿数量比较多，也建议进行腹腔镜手术，因为反复穿刺会出现出血，也会给患者带来不良影响；2、腹腔镜或穿刺手术：对于靠近外周、背部的囊肿，如果囊肿较小、单发且没有分隔，可以选择腹腔镜或者经皮穿刺抽吸硬化治疗，同样可以获得治疗效果。