儿童衣原体肺炎最典型的症状是咳嗽，同时也是常见症状。衣原体肺炎的咳嗽多数以干咳为主，呈阵发性。阵咳时可能会比较剧烈，也可能会在夜间咳嗽比较明显。除咳嗽外部分患者还会出现发烧，可能是高热，也可能是低热，多数以低热为主。部分患者有可能合并有喘息症状，或者上呼吸道感染的症状，如流鼻涕、打喷嚏、鼻塞、眼部分泌物增多、揉眼，以及咽喉肿痛等。如果症状较重，重症衣原体肺炎可出现重症肺炎的症状，例如可能会出现呼吸急促、呼吸困难、呼吸频率显著增快。吸气时可以看到三凹征，胸骨上窝、肋间隙明显向内凹陷，重症患者会出现口唇发干、口唇青紫的情况。如果出现呼吸困难、呼吸急促、精神状态差等情况，考虑是重症衣原体肺炎，需要立即带儿童到医院就诊。