头孢克肟与头孢丙烯都属于头孢类的抗菌药物，但头孢克肟属于三代头孢，而头孢丙烯属于二代头孢。头孢丙烯这类二代头孢的特点是相比一代头孢，对于革兰氏阳性球菌的抗菌活性有所下降，但是对于革兰氏阴性杆菌的抗菌活性有所增强，肾毒性也有所减弱。头孢克肟这类三代头孢的特点就是对于革兰氏阳性球菌的抗菌作用，会弱于一代头孢和二代头孢，但是对于革兰氏阴性杆菌的作用有所增强。而且对于革兰氏阴性菌产生的β-内酰胺酶，相对更为稳定。由于头孢克肟和头孢丙烯的抗菌作用特点的不同，临床使用方面的适应证也有所区别。如头孢克肟适合用于治疗对于头孢克肟敏感菌属的一系列细菌感染，包括支气管炎、肺炎、肾盂肾炎、尿道炎以及胆囊炎等，而头孢丙烯用于头孢丙烯敏感的一系列细菌感染的治疗。