肛周脓肿首先服用抗生素，局部做引流或不做引流的情况下必须要口服抗生素。抗生素一般选用高效、广谱的抗生素，其能够控制厌氧菌，或其它革兰氏阴性菌、阳性菌。在口服抗生素的情况下，一定要观察血象和临床症状变化。如果吃药以后症状逐步缓解，局部疼痛明显减轻，症状得到控制，说明治疗有效。如果症状要进一步加重，疼痛明显加重，应该静脉输液或者采用手术治疗，不能单纯口服抗生素。 另外，因为部分肛周脓肿患者会并发便秘，要适当给予通便、润肠药物，使大便容易解出，有利于肛周脓肿的治疗和恢复。如果合并有糖尿病或其它少见疾病，一定要口服或用治疗原发疾病的药物，在治疗上才能达到最好疗效。