血-脑屏障对于大脑有重要的功能，可以保证大脑与营养供应相关的有用分子，如葡萄糖等，能够通过血-脑屏障，对大脑进行物质交换和养分供应。将不好的物质拒之门外，减少对大脑的干扰。有些药物在正常情况下可能不能通过血-脑屏障，但是在炎症状况下可以通过血-脑屏障进入大脑，可能对人体仍然有利。若出现中枢神经系统感染，如细菌性脑膜炎，此时应利用血-脑屏障的特点，选择可以通过血-脑屏障的抗生素，通过血-脑屏障进入大脑，进行抗感染的作用。