跑步的时候肚子右边会疼，可能是肌肉牵扯痛，也需要考虑其他器质性疾病。1、牵扯痛：最常见的可能是在跑步时，引起腹部肌肉、韧带或皮肤的牵拉伤、肌肉痛。如果跑步后不疼了，高度怀疑是肌肉、韧带牵拉引起来的疼痛；2、其他疾病：跑完步后右边腹痛没有消失，考虑会不会有其他疾病。如位于右上腹需要考虑胆囊炎、胆囊结石，位于右侧中腹需要考虑泌尿系输尿管、肾盂、肾盏结石，位于右下腹需要考虑有没有急性或慢性阑尾炎，女性还要考虑盆腔炎、腹腔炎的可能。