先天性颅骨缺损的病因一般为婴幼儿脑膜或脑组织膨出导致颅骨闭合受阻，随着脑部的发育生长，未闭合处逐渐形成缺损。如先天性颅骨缺损患者的缺损面积较大，一般需进行钛合金、钛板等人工骨的修补手术，同时需针对造成缺损的原因进行处理。如病因为脑膜及脑组织膨出，需将膨出的脑膜及脑组织压至脑内，进行严密的缝合，并使用修复材料进行颅骨缺损的修补，以保护脑组织。