经食管超声心动图在临床上有非常重要的应用价值，可以避免很多经胸超声受干扰的因素，非常清晰的观察到心脏结构功能等，对瓣膜病、主动脉大血管疾病、天性心脏异常等，都是非常有效的补充。但是有并发症： 1、最主要的就是对食管的损伤，在检查前要先了解患者有没有食管问题； 2、食管紧邻心脏，探头在食管里面对心脏会有触碰，触碰过程有可能会诱发和引起心律失常，并发症其中之一是心律失常，在及时终止检查的时候就会停止； 3、有一些病人在做的过程当中由于胃或者食管有问题，没有告知医生，医生也不知道，会引起食管或者胃的黏膜出血、穿孔等。