脑梗塞引起的脑萎缩，服用治疗脑梗塞的药物最好，如抗血小板聚集药物阿司匹林、氯吡格雷，可改善血液循环。若存在心源性因素引起的脑梗塞，需要使用抗凝药物，比较常用的抗凝药物为华法林，需要监测INR。新型的抗凝药物，主要包括达比加群酯、利伐沙班，可有效改善血液循环和改善脑萎缩。还要部分患者有抽烟、喝酒的嗜好，需要戒烟、戒酒，补充维生素B1、维生素B12、维生素B6等，改善神经功能、脑萎缩症状。可以使用改善脑功能的药物，如银杏叶片，可改善脑萎缩、脑梗塞的症状。此外，还可使用茴拉西坦、奥拉西坦来改善脑功能。急性期可使用丁苯酞改善微循环，依达拉奉可去除氧自由基，起到脑保护、改善脑梗塞和脑萎缩的作用。