巨结肠手术后的恢复时间需要根据具体情况来判断，具体如下：1、小儿：巨结肠手术方式不同，手术恢复的时间也不同；2、成人：术后2个星期切口和吻合口基本可以长好，但是肠功能的恢复可能需要2-3个月，有些甚至需要半年，这是比较正常的情况。根据成年人手术的具体方式不同，部分人是做全结肠切除即回肠和直肠吻合，部分人是做结肠次全切即右半升结肠和直肠吻合，手术的恢复与手术方式有一定关系，所以每种手术的恢复只有大概时间。