子宫内膜异位症的治疗分为药物治疗和手术治疗。药物治疗的一线药物有短期口服避孕药、假孕疗法及假绝经疗法之类的药物；二线药物为GnRHa类药物，28天左右皮下注射一次。药物治疗不能根治，只能控制症状。手术治疗又分为保留生育功能手术、保留卵巢功能手术和根治性手术，保留生育功能手术，主要是剥除卵巢囊肿和切除子宫腺肌瘤，术后需要辅助药物治疗；保留卵巢功能手术，是子宫全切和卵巢囊肿剥除；根治性手术，是切除全子宫和双侧附件。