头颅检查包括颅脑、眼眶、鼻咽及颌面部，涉及到病种较多。颅脑部位，MRI可检查脑肿瘤、炎症、脑萎缩、脑积水、脑白质病变等；腹部分为上腹部、下腹部及盆腔，其中，上腹部包括肝脏、胆系、胰腺、脾脏、肾上腺、肾、肾脏、泌尿系。盆腔包括的除膀胱外，女性包括子宫、附件及卵巢，男性包括前列腺、精囊腺。部分疾病如肝脏病变等，进行MRI检查较好。