多囊肾手术治疗有一定的适应症和手术时机，临床上会根据多囊肾患者的具体情况，决定是否手术治疗。若患者处于多囊肾早期，囊肿数量较少、体积较小，肾功能正常，建议先采取非手术治疗；若患者处于多囊肾失代偿期，囊肿数量较多、体积较大、肾功能下降，出现腰部疼痛、腹部疼痛、高血压等临床症状，建议立即手术治疗；若患者处于多囊肾尿毒症期，肾功能已经衰竭，一般不再建议手术治疗。