肿瘤专项筛查指专门针对肿瘤进行筛查，通常按不同癌肿进行筛查，主要针对我国癌症发病率前八位癌种进行筛查，如肺癌、胃癌、大肠癌、肝癌、甲状腺癌、乳腺癌、宫颈癌等。依据国内外筛查指南或专家共识，筛查项目设计更有针对性，检查更深入、更精准，如胃镜、肠镜检查。此类筛查对设备、检查医生、检查方式、检查时间具有更高要求，并非所有内镜医生均可完成。针对部分癌种会选择准确性和敏感性更高的肿瘤标志物。相对于普通健康体检，早期肿瘤发现率明显提高，但费用亦更高。